Principalele ramuri

Autecologia: ecologia speciilor individuale, răspunsul acestora la stimuli, adaptarea.

Sinecologia: ecologia ansamblului speciilor.

Ecofiziologie

După biomul studiat

Ecologie polară

Ecologia deşertului

Ecologie tropicală

Ecologie bentică

Ecologia pădurilor

După specia studiată

Ecologia animalelor

Ecologia plantelor

Alte ramuri

Biogeochimie

Macroecologie

Microecologie

Ecotoxicologie

Paleoecologie

Ecologie socială

Eco-artă

Antropologie ecologică

Agroecologie

Ecologia solului

Ecoevoluţie

Ecologie industrială

Chimie ecologică.